疾病管制局於1月5日與9日分別接獲一例疑似腸病毒感染併發重症通報個案，該局綜合病程與實驗室資料判定兩者均為重症確定病例，目前兩名個案檢體之初步檢驗皆為腸病毒71型陽性。個案一為1歲8個月男童，自1月2日起，即陸續出現發燒、手足口病、食慾不佳等腸病毒感染症狀，次日因出現抽搐而赴急診，因有呼吸窘迫現象轉入加護病房，隨即因心肺衰竭施以心肺復甦術，目前病況仍處危急。個案二為1歲7個月女童，自1月3日起，即陸續出現發燒、手足口病、等腸病毒感染之症狀，1月6日出現抽搐赴急診而後轉診至醫學中心，因有併發腦炎現象於加護病房觀察治療，目前病況已穩定恢復中。疫調發現，僅個案一於近期曾接觸3名手足口病患者，然該3名患者目前均已痊癒。
依據該局監視資料顯示，臺灣全年都有腸病毒感染個案，而腸病毒71型在沉寂兩年後，最近活動情形有上升的趨勢，歷年的重症患者中約有20％至60％是感染腸病毒71型，腸病毒71型也是造成腸病毒重症死亡最主要的病毒型別。該局呼籲民眾及教保育機構，雖然目前並非歷年腸病毒流行的高峰期，還是要隨時注意個人、幼兒及學童衛生，以降低感染機會，進而避免重症的發生。本年截至1月13日止，共計通報3例腸病毒感染併發重症個案，其中2例確定，1例排除，去（2007）年累計通報49例腸病毒感染併發重症病例，其中12例判定為確定病例（6例檢出腸病毒71型，1例檢出伊科病毒第6型）。
腸病毒的傳染力極強，在人與人密切接觸、互動頻繁的處所，如家庭與教保育機構（幼稚園、托兒所、安親班）等地方最容易傳播，3歲以下嬰幼兒因為免疫力較低，且本身無行為自主能力，或無足夠能力管理自身衛生，容易經由大人摟抱、親吻，或與其他孩童遊戲互動時而感染腸病毒。由於多數人感染腸病毒後不會出現症狀，或症狀輕微類似一般感冒，無形中可能將病毒傳播給家中嬰幼兒卻不自知，而3歲以下嬰幼兒是腸病毒感染併發重症的高危險群，因此，該局提醒民眾特別注意自身與嬰幼兒的衛生，自外面回家後，在摟抱、餵食嬰幼兒前，大人及小孩務必正確洗手，以降低嬰幼兒感染腸病毒的機會。若家中嬰幼兒經醫師診斷感染腸病毒時，要注意觀察患者是否出現腸病毒感染併發重症的前兆病徵，如有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力、肌躍型抽搐、持續嘔吐、持續發燒、煩躁不安、昏迷、頸部僵硬、肢體麻痺、抽搐、呼吸急促、心跳加快等疑似腸病毒重症症狀時，請務必立即就醫，儘速接受適當的治療，以免錯過治療的黃金時間；坊間診所臨床醫師看診時，如發現幼童出現重症前兆病徵，亦應建議家長儘速轉診大醫院小兒科急救，以免貽誤病情。
此外，該局也特別提醒教保育機構，要注意活動環境的衛生及通風，及幼學童衛生習慣的教育與養成，玩具（尤其是帶毛玩具）要經常清洗消毒，並隨時注意幼兒、學童健康狀況，若發現異狀，應立即通知家長，迅速就醫。若要獲得更多腸病毒防治常識，請至該局全球資訊網，網址進入「防疫專區/疾病介紹/第三類傳染病－腸病毒感染併發重症」，可查詢疾病介紹、預防保健、治療照護與防治政策等相關資訊，或就近洽詢所在地衛生局。