上週（9月4日至9月10日）新增10例境外移入登革熱病例，感染國家為印尼4例、越南3例、泰國2例、馬來西亞1例。東南亞/南亞近期登革熱疫情處相對高點或呈上升趨勢，新加坡、越南、菲律賓、柬埔寨、寮國及斯里蘭卡疫情皆高於去年同期。由於東南亞/南亞疫情升溫，境外移入病例持續發生；氣象預報本週受颱風影響，南部地區有陣雨機會，且上週降雨，致積水容器增加，病媒蚊孳生，本土疫情風險升高。 

恙蟲病仍處流行期，個案感染地主要為花東地區及離島縣市，台東縣、花蓮縣及高雄市病例數較近二年增加。 

腸病毒疫情持續趨緩。上週全國門、急診腸病毒就診人次（6,934）較前一週（7,257）下降4.5%；各級學校已開學，研判開學後可能出現一小波流行。惟社區仍以感染克沙奇A型之輕症為主，腸病毒71型仍有散發個案。上週無新增腸病毒重症個案，今年累計18例確定個案，其中17例感染腸病毒71型、1例感染克沙奇A5型病毒。日本疫情處相對高點，呈上下波動趨勢，惟為近10年同期最低；中國大陸、香港、澳門、韓國、泰國及新加坡疫情持續下降或近基礎值。 

新加坡茲卡本土疫情持續，近期每日約增12例，8月27日至9月12日累計確診333名病例，包含8名孕婦，個案多分布於阿裕尼灣（Aljunied Crescent）、沈氏通道（Sims Drive）等7個群聚地區。泰國首都曼谷中部沙吞區（Sathon）近期新增逾20名病例；該國今年累計報告逾100名茲卡病例，集中於中、北部，多數為輕症；目前至少30名孕婦個案，當中6名產下之新生兒無明顯異常，當局預期病例數持續增加。其餘東南亞國家如越南、泰國及馬來西亞等近期亦有公佈零星本土茲卡疫情，該等為國人經常往返國家，故我國境外移入風險升高。 

世界衛生組織（WHO）9月8日公布，全球累計69國家/屬地出現茲卡本土病例，疫情以中南美洲及加勒比海地區最為嚴峻，雖部分地區病例數趨緩，惟整體疫情持續，仍須提高警覺。疾管署已將具流行疫情或可能有本土傳播之60國或屬地，包括亞洲泰國、菲律賓、越南、印尼、新加坡及馬來西亞6國旅遊疫情建議第二級警示。