國人對於食品製造加工源頭管理的重視與日俱增，為確保受規範之業者符合食品安全管制系統(HACCP)準則之規定，食品藥物管理署(以下稱食藥署)會同20縣市衛生局至105年9月底已針對乳品、肉品、餐盒及水產品計242家製造業者進行稽查。查核重點涵蓋食安五環精神：就食品業者登錄及食品添加物來源進行查核以達「源頭控管」；為完善食品生產鏈之紀錄管制，查核業者之食品追溯追蹤系統以建全「生產管理」；強化政府三級品管，稽查業者一級品管(強制檢驗)、HACCP、食品良好衛生規範準則(GHP)符合性及產品標示，以落實「加強查驗」；為「加重廠商責任」對於違法之業者衛生單位依法處辦；並公布查核結果以達到資訊透明「全民監督」。

食藥署為強化食品安全，積極推動食品業者登錄、追溯追蹤及強制檢驗等各項食品管理策略，同時藉由輔導計畫及專案查核等措施，強化業者自主管理，由今年度HACCP專案查核結果顯示，業者對於各項管理政策之符合率呈上升之趨勢。食品業者登錄104年完成率為98.57%，105年完成登錄率達100%；追溯追蹤合格率已由104年度的35.83%上升至87.68%；強制檢驗查核結果合格率達89.85%；HACCP及GHP合格率達9成以上，過去常見缺失如HACCP管制小組未定期召開會議、未有管制小組內部稽核紀錄、設備與器具未保持清潔及未有客訴與回收紀錄等項目，符合率亦由6成提升至8成以上；稽查結果不符合者，已命其限期改正，屆期未改善完成者，衛生局均已依法處辦。

食藥署將持續針對國內應實施HACCP系統之食品業者展開稽查行動，並秉持行政院「食安五環」核心架構，使業者達到自主管理效果並落實強化源頭控管，以保障民眾飲食衛生安全。