衛生署已明令:性別篩選為中央主管機關規定不得從事之醫療行為，違者將依醫療相關法規論處- 衛生福利部

外電報導，現在的醫學檢驗技術，可於孕婦7週左右，驗血知道胎兒性別乙節，國民健康局表示：衛生署已於本（100）年1月13日衛署醫字第1000200809號令訂定「醫師執行非性聯遺傳疾病診斷所施行產前性別篩選之處置，或僅以胎兒性別差異為由進行之人工流產等行為，為醫師法第28條之4第1款規定不得從事之醫療行為」。如查獲有性別篩選或依性別進行墮胎之實證者，即可直接處分醫師10-50萬元罰鍰，情節重大者，甚至可廢止醫師證書。
此外，查依醫事檢驗師法第12條第2項及第17條第2項規定，醫事檢驗師(生)執行業務，應依醫師開具之檢驗單為之；同法第33條亦規定「未取得醫事檢驗師或醫事檢驗生資格而執行醫事檢驗業務者，處二年以下有期徒刑」。因此，醫事檢驗所、生技公司及實驗室非法執行性別篩檢業務時，將依前揭規定論處。
針對性染色體相關遺傳（即性聯遺傳）疾病檢測檢測產品管理部分，衛生署已明訂「商品化之性染色體相關遺傳（即性聯遺傳）疾病檢測試劑應以醫療器材列管，且該等商品不得用於胎兒性別預測，並應於仿單上加註『本產品不得用於檢測性聯遺傳疾病以外之胎兒性別』」。違者，將依藥事法第66條及第92條規定論處。