有關外界指出中央政府無法掌握此次航空公司麻疹群聚個案接觸者通聯資料，導致地方衛生單位追蹤接觸者效率不彰，疾病管制署強調，針對本次麻疹群聚事件，均於個案確診後立即發布新聞稿，並提供個案航班資料讓民眾注意，此外，防疫人員亦同步針對相關接觸者（旅客）造冊追蹤，資料調查流程說明如下：

• 向航空公司提交「航空器傳染病接觸者航艙資料申請單」，資料包括旅客護照號碼、英文姓名、國籍，僅部分有留電話號碼；另由於乘客未必是本國籍，故身分確認以護照號碼為主。
• 至內政部移民署「應用服務系統」以護照號碼查詢，取得本國籍旅客身分證號。
• 至內政部「戶役政系統」及疾管署「預防接種資料查詢系統」（NIIS），以身分證號查詢，取得旅客戶籍地址或部分聯絡資訊。

疾管署表示，由於旅客資料收集過程十分繁複，旅客資料不完整的原因，可能為：旅客護照號碼在內政部入出境旅客資料庫中查詢不到身分證資料，導致無法取得完整資料；內政部「戶役政系統」中有未登錄旅客實際居住地，且該系統資料欄位無電話項目；疾管署NIIS系統為2002年建置，對於年長者資料較不齊全，常有查無紀錄等情形發生，目前僅能將可得資料提供地方衛生局，由防疫人員循址親訪或再轉介其他縣市繼續追蹤。惟因麻疹疫情不容小覷，疾管署未來將透過中央部會間的協調，以尋求解決方案，減輕第一線防疫人員工作壓力及提升防疫效率。

疾管署呼籲，目前有18航班（如附件）之接觸者仍在健康監測期，相關日期及航班如附件，請曾搭乘該航班但未收到衛生單位聯繫追蹤的旅客，可撥打免付費防疫專線1922（或0800-001922），後續將有防疫人員主動關懷；民眾如有麻疹相關疑問，可至疾管署全球資訊網「麻疹專區」瀏覽。