統計至110年4月11日止，衛生福利部已收到0402臺鐵408次列車事故案民眾捐款計33萬218筆、8億1,410萬餘元，為落實善款監督管理，衛福部已第一時間籌組衛生福利部辦理0402臺鐵408次列車事故案捐款管理及監督委員會，並於4月12日召開第1次委員會議。

委員會召集人由本部李麗芬政務次長擔任，且為考量本次列車事故案受難相關對象之扶助需求，該委員會敦聘含括社會福利、醫療、法律及會計等各層面的社會公正人士，成員包括有:臺灣大學社會工作學系教授鄭麗珍、財團法人台灣兒童暨家庭扶助基金會執行長何素秋、臺北市立聯醫昆明防治中心主任陳亮妤、律州聯合法律事務所主持律師賴芳玉，及資誠聯合會計師事務所所長周建宏擔任民間委員，並有相關政府部會含交通部、教育部、法務部、外交部、內政部及原住民族委員會等，以及衛福部社會及家庭署、中央健康保險署、醫事司及心理及口腔健康司等單位代表共同組成。

李召集人於會後表示，會中討論針對捐款運用對象，包括:罹難者遺屬、傷者及其家屬、目睹乘客及救災人員；運用項目包括:罹難者之遺屬、傷者及其家屬之生活扶助、醫療補助、教育資助…等。除罹難者家屬與傷者之外，並提供目睹乘客及救災人員之心理重建，以及經委員會專案同意之項目。經會議委員共識發給所有罹難者家屬生活扶助金之總額，以不低於實際收受捐款金額之三分之一為原則。另為有效運用善款，委員會在4月底前，每周召開1次委員會議。並預定下週將邀請地方政府參與會議，針對就罹難者家屬及傷者個別需求提供捐款運用之建議。

本次會議針對捐款管理的監督機制，及扶助對象之需求等重要議題，進行充分討論以納入各部會及民間委員們的建議，並達成共識。感謝各界的愛心，所有相關捐款細目都將公開徵信，預計將於110年4月15日(星期四)零時起，停止收受捐款(110年4月14日為最後捐款日)。

捐款秉專款專用及公開透明原則，相關資料衛福部已於官網設立專區，除已每日(上班日)上午11時公布捐款筆數、金額外，將定期公告捐款運用情形，讓捐款人以及社會大眾掌握捐款的流向，共同監督善款的使用。