疾管署最新研究指出，自2015年6月起，國內陸續發現部分志賀氏桿菌對巨環類口服抗生素「Azithromycin」產生抗藥性，為亞洲首次報告志賀氏桿菌具此種抗藥性。提醒臨床醫師選擇桿菌性痢疾治療用藥時，應參考藥物敏感性試驗結果，慎選合適抗生素，必要時應會診感染科醫師。此研究結果已刊登於美國疾病控制預防中心最新一期（2月號）出版的「新興傳染病」期刊。

疾管署表示，志賀氏桿菌為世界衛生組織（WHO）建議各國優先列入抗藥性監測的七大致病菌之一，可引起桿菌性痢疾。過去國內外分離之志賀氏桿菌普遍對常用口服抗生素（如盤尼西林類Ampicillin、喹諾酮類Ciprofloxacin、磺胺類TMP/SMX）有單一或多重抗藥性，但自2015年以來，歐洲、美國、澳洲研究報告均發現志賀氏桿菌對巨環類口服抗生素Azithromycin具抗藥性，導致臨床治療可用藥物越來越少，必須使用口服或針劑之第三代頭孢子素或其他僅有針劑之後線抗生素治療；若抗藥性持續演化或累積，恐將成為無藥可醫的「超級細菌」。

疾管署自2015年6月首次於國內發現具巨環類抗藥性的志賀氏桿菌（Shigella flexneri血清型3a），一年內共計21例，約佔同時期200例桿菌性痢疾確診個案的十分之一。這些個案集中於北、中部都會區22至44歲男性，均無國外旅遊史，但其菌株經全基因體定序分析，結果與歐美流行菌株型別一致，不排除是經由境外移入個案造成人傳人的散發病例，所幸國內此菌株對於喹諾酮類Ciprofloxacin、磺胺類TMP/SMX、第三代頭孢子素未具抗藥性。因醫療院所藥物敏感性試驗常規項目不包含巨環類抗生素，臨床醫師如果憑經驗使用這類口服抗生素恐治療失敗，建議醫師務必參考藥物敏感性試驗結果、慎選合適抗生素，必要時應會診感染科。疾管署將持續監測此一抗藥性趨勢，提供醫師作為治療參考。

疾管署也將於今（2017）年執行的「重要微生物之抗藥性監測及流行病學研究計畫」建立菌株收集平台，預計針對WHO建議優先列入抗藥性監測的七種致病菌（大腸桿菌、克雷白氏肺炎桿菌、金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、沙門氏菌、志賀氏桿菌、淋病雙球菌），收集2,500株菌株及其流行病學資料，監測抗藥性趨勢變化及進行國際比較，利用分子流行病學工具偵測抗藥性機制及演變，以利採取必要防治作為。