「健康食品工廠良好作業規範」係由行政院衛生署(衛生福利部前身)依據健康食品管理法第10條第3項規定，於88年7月2日以衛署食字第88036661號公告，並自88年8月3日健康食品管理法施行日起施行，迄今已逾二十餘年。

      為精進健康食品製造業者(下稱製造業者)之製造管理，經參採並調和我國食品製造業者及國際相關規範後，擬訂定「健康食品製造良好作業規範標準」草案(下稱本標準草案)，希冀本標準草案可兼具在地化並與國際接軌，以助於整體提升我國健康食品之國際競爭力；另為符合中央法規標準法之規定，原「健康食品工廠良好作業規範」將於本標準草案施行後同步廢止。

本標準草案內容主要重點如下：

一、製造業者品質管理系統應採行之措施與建立文件內容。
二、製造業者之組職架構、人員之條件及資格，及食品從業人員教育訓練規定。
三、廠房設施與設備及衛生管理規定。
四、文件之制定與發行及產品開發規定。
五、製程管制、倉儲與運輸管制及品質管制規定。
六、食品安全管制、產品安定性及委託製造或檢驗規定。
七、追蹤、申訴、產品回收、內部稽核、矯正及預防措施規定

      本標準草案之評論期自預告之日次日起共60日，以蒐集各界意見，並預定於自正式發布後一年施行；健康食品製造業者倘未依本修正草案規定製造健康食品，將依違反健康食品管理法第23條規定，處新臺幣3萬元以上15萬元以下罰鍰；於一年內再次違反者，處新臺幣9萬元以上90萬元以下之罰鍰，並得廢止其營業或工廠登記證照；未依本標準草案規定製造健康食品致危害人體健康者，將處3年以下有期徒刑、拘役或科或併科新臺幣100萬元以下罰金，並得廢止其營業或工廠登記證照。